サンゴ礁は、地球規模（温暖化による水温上昇、海洋酸性化等）と地域規模（陸源負荷等）両方のストレスによって近年急速に衰退していることが指摘されています。
しかしながら、現地の情報は断片的で定量性に欠けており、実海域でのストレス低減に関して具体的な数値を示すことができない状況にあります。

本計画研究においては、地球温暖化、人間居住史、都市化や農林畜産業の構造変化に伴う変化に着目し、ストレス項目を計画研究A01、 計画研究A02と選定し、客観的なデータ（空中写真、衛星データ、地図、報告書データ、サンゴ年輪解析データ）に基づいて過去100年間のストレス要因とサンゴ礁の歴史的変化を統一的に解析し、負荷の程度の異なる地域を比較することにより、ストレスの増加とサンゴ礁の衰退を検証します。
その上で、衰退に対するストレスの複合影響と閾値を明らかにし、計画研究B02とともにストレス変化の社会的背景を明らかにします。
復元結果を用いて計画研究C01と計画研究C02と共同でモデルの検証を行い、未来像の描出を行います。